Une université d’excellence
Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).
Une université engagée
Vigilante envers toutes formes de discriminations, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. Elle est attachée aux fondements du service public, à la laïcité, à l’égalité des chances et à l’accès de tous aux savoirs. Elle promeut les valeurs académiques telles que l’éthique, l’intégrité scientifique et la liberté universitaire. L’UM place enfin le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.
Dans le cadre de ses engagements, l’université promeut le CV sans photographie.
Structure de rattachement : Institut des Biomolécules Max Mousseron (IBMM)
Ce doctorat fait partie du projet de recherche ANR Alterine, qui vise à développer de nouveaux analogues peptidiques pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens. Le projet ANR est une collaboration entre l'Université de Brest (Y. Fleury), l'ICGM (JM Campagne, R de Figueiredo) et l'équipe IBMM SynBio3 et Peptide (P. Verdié, G. Subra, C. Echalier).
Les composés à développer seront dérivés des altérines, une famille de peptides antibactériens présents dans les bactéries marines très actives contre les bactéries à Gram négatif. Ces cyclolipopeptides présentent un cycle heptapeptidique et une queue hydrocarbure, et comprennent plusieurs acides aminés non canoniques ainsi que plusieurs isoformes naturelles (voir Figure). Leur mécanisme cible le lipopolysaccharide (LPS), dont la structure 3D est stabilisée lors de la liaison au LPS, ouvrant la voie à des analogues efficaces et à faible toxicité.
Dans ce contexte, il est nécessaire de concevoir des analogues, promédicaments et conjugués afin d'améliorer l'efficacité et la sélectivité des analogues d'Alterine. Il faudra d'abord déterminer la structure des altérines, c'est-à-dire la synthèse d'acides aminés non canoniques (en particulier l'acide diaminobutyrique) en tant que blocs de construction protégés par l'uréthane. Ensuite, différentes stratégies combinées de phase de solution et de phase solide seront étudiées afin de permettre la préparation de petites bibliothèques d'analogues variant en position cruciale dans la structure de l'altérine afin d'explorer la relation structure/activité. En particulier, des stratégies reposant sur l'ancrage des chaînes latérales ou les réarrangements de décalage N/O de l'acyl seront testées pour une synthèse efficace, la chaîne latérale lipidique sera modifiée. Des analogues de promédicaments seront développés avec des dérivés dépsipeptidiques.
Mission principale :
Déterminer, par plusieurs méthodes, les configurations absolue et relative de tous les acides aminés.
Synthèse des blocs de construction non canoniques des acides aminés (-OH Dab et déhydrobutyrine, Dhb) pour la synthèse de l'altérine naturelle et des analogues. Selon la stéréochimie obtenue par analyse de Marfey, la synthèse du -OH Dab sera réalisée à partir de 5-hydrox-yectoïne selon le protocole développé par ICGM [1]. L'autre diastéréomère (S,R) pouvait également être obtenu via une stratégie aldolologique utilisant le (S,R)–diphényloxazinone chirale de Williams [2]. Les résidus de Dhb (déhydrobutyrine) non protégés sont instables et seront obtenus par déshydratation d'une thréonine protégée.
Développement de stratégies de synthèse et de cyclisation en phase solide non grémisantes, en commençant d'abord par l'utilisation de l'acide bêta-hydroxy-diaminobutyrique comme premier résidu C-terminal ancré sur la résine 2-chloro chlorotrityl. D'autres positions d'ancrage seront étudiées afin de permettre une modulation facile de la partie lipidique. Le doctorant développera l'étape d'ancrage et l'activation du C-terminus, en particulier en tant que dérivée azido.
En étroite collaboration avec les équipes de biologistes et dans le contexte des résultats des bioanalyses, des bibliothèques ciblées d'analogues seront préparées par le doctorant, modulant une position importante dans la séquence afin d'accroître la spécificité et la stabilité.
Synthétiser des analogues de dépsipeptides en tirant parti du -OH Dab, et étudier leur réarrangement.
Exploration des dérivés de promédicaments en masquant les chaînes latérales avec des groupes masqueurs enzymatiques ou sensibles au pH.
Activités :
Synthèse organique
Synthèse stéréossélective d'acides aminés protégés
Analyse chimique (NMR, LC/MS, analyse de Marfey)
Synthèse en phase solide de peptides
Il/Elle utilisera les ressources des deux équipes impliquées dans le projet (équipe peptide IBMM et ICGM 'D2') mais aussi des installations de la plateforme SynBio3 et du PAC Balard de l'UAR
Spécificités du poste :
Contraintes liées au travail expérimental en chimie synthétique
Pour garantir la sécurité des manipulations, la personne recrutée sera formée aux bonnes pratiques de laboratoire (GLP) et à l'utilisation des équipements. Cette formation comprendra des instructions sur la manipulation sûre des produits chimiques et biologiques, ainsi que sur la gestion des déchets conformément à la réglementation en vigueur
Qualifications / Domaine de formation demandé :
Niveau sc en chimie organique, synthèse et analyse chimique des biomolécules
Les bases en chimie des peptides, en bactériologie et en biologie seront appréciées
Travail d'équipe
Rigueur et organisation
Anglais scientifique
Compétences en rédaction et en reporting
Autonomie et initiative
Rejoindre l'université de Montpellier, c'est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.
Nos avantages :
> Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes
> Jusqu’à 46 jours de congés / an (pour un temps plein à 38h30)
> Temps de travail aménageable
> Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM)
> Restauration collective
> Aide et prestations sociales
> Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville
> Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université
> Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade
Avantages dépendant de la nature et la durée du contrat, des nécessités de services et des conditions d'éligibilité
Informations complémentaires :
Rémunération : 2300 € bruts mensuels
Prise de poste : 01/10/2026
Type de contrat : CDD de catégorie A
Durée du contrat : 3 ans
Clôture des candidatures : 20/05/2026