Ingénieur d’études en biologie cellulaire et moléculaire (F/H)

CDD
14 mois
Montpellier

A propos de nous

Une université d’excellence

Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).

Une université engagée

Vigilante envers toutes formes de discriminations, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. Elle est attachée aux fondements du service public, à la laïcité, à l’égalité des chances et à l’accès de tous aux savoirs. Elle promeut les valeurs académiques telles que l’éthique, l’intégrité scientifique et la liberté universitaire. L’UM place enfin le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.
Dans le cadre de ses engagements, l’université promeut le CV sans photographie.

Structure de rattachement : Cellules souches plasticité cellulaire régénération tissulaire et immunothérapie des maladies inflammatoires (IRMB)

Mission proposée

Intitulé du projet : FACIL

Acronyme du projet : FACIL

Durée globale du projet : 45 mois

Description sommaire du projet : Le projet FLACIL vise à décrypter les mécanismes moléculaires impliqués dans les dyskinésies ciliaires primitives (PCD) et les anomalies flagellaires (MMAF) en s’appuyant sur des modèles humains dérivés de cellules souches pluripotentes induites (iPSC). Le projet combine l’édition génomique par CRISPR/Cas9, la différenciation en organoïdes pulmonaires, l’analyse fonctionnelle des cils et des approches multi-omiques intégratives (transcriptomique, protéomique, interactome) afin d’identifier de nouveaux gènes impliqués et de mieux comprendre leur impact physiopathologique.

Mission principale : Sa mission principale portera sur le WP4, intitulé Impact de la déficience génique sur les cils à l’aide de modèles de cellules iPS pour des études fonctionnelles et pathophysiologiques. Ce volet comprendra la génération de modèles iPSC modifiés, leur différenciation en organoïdes pulmonaires ainsi que l’analyse fonctionnelle et moléculaire des cils. Une contribution est également attendue dans le WP5, dédié à l’intégration et à l’analyse des données multi-omiques produites dans le cadre du projet.

Définition des tâches à accomplir :

– Réaliser les manipulations expérimentales liées à l’édition génomique d’iPSC, leur différenciation en organoïdes pulmonaires et en épithélium respiratoire cilié, ainsi que l’étude de la fonctionnalité des cils à partir de ces modèles

– Génération et validation de lignées iPSC éditées par CRISPR/Cas9

– Différenciation des iPSC en progéniteurs pulmonaires puis en organoïdes pulmonaires et cultures air-liquid interface

– Étude de la fonctionnalité des cils à partir de ces modèles (analyse du battement ciliaire, mucociliary clearance, microscopie confocale et électronique)

– Caractérisation moléculaire des organoïdes (immunofluorescence, qRT-PCR, analyses transcriptomiques bulk et single-cell, protéomique)

– Participation à l’analyse et à l’intégration des données multi-omiques en lien avec les partenaires

– Participation à la gestion du stock et les commandes au sein du laboratoire

– Rédaction de rapports scientifiques, contribution aux publications et participation aux réunions du consortium

Description précise de l'évènement ou du résultat objectif déterminant la fin de la relation contractuelle ainsi que les modalités d'évaluation et de contrôle de ce résultat : 

L’atteinte des objectifs sera évaluée sur la base :

– de la génération et validation des lignées iPSC éditées,

– de la mise en place des organoïdes pulmonaires différenciés,

– de la production et de l’analyse des données fonctionnelles (battement ciliaire) et multi-omiques,

– des livrables scientifiques (rapports intermédiaires et finaux, publications, présentations consortium).

Un suivi régulier sera assuré lors des réunions d’avancement du projet.

Notre profil idéal

Qualifications / Domaine de formation demandé :

Master 2 en biologie cellulaire, biologie moléculaire, biotechnologies, génétique ou domaine connexe.

Expérience souhaitée en culture de cellules souches pluripotentes (iPSC), différenciation en organoides et édition génomique CRISPR/Cas9


Savoir-faire

•           Maîtrise des techniques de biologie cellulaire appliquées aux modèles tridimensionnels (culture iPSC, différenciation, organoïdes).

•           Expérience en manipulation de dispositifs microfluidiques et organoïdes sur puce (organ-on-chip) pour des études fonctionnelles.

•           Capacité à analyser des données expérimentales issues de modèles in vitro (imagerie, analyses fonctionnelles).

•           Gestion et intégration de données expérimentales pour des approches fonctionnelles et pathophysiologiques.

•           Rédaction et documentation scientifique des résultats.

Compétences techniques

•           Culture cellulaire et différenciation de cellules iPS en modèles organoïdes.

•           Manipulation de dispositifs microfluidiques et de systèmes organoïdes.

•           Analyse de données fonctionnelles et d’imagerie

•           Mise en œuvre de protocoles expérimentaux reproductibles et documentés.

•           Connaissance des outils d’analyse adaptés aux modèles in vitro.

Savoir-être

•           Rigueur et sens de l’organisation.

•           Capacité à travailler en équipe dans un environnement multidisciplinaire.

•           Autonomie et esprit d’initiative.

•           Adaptabilité face aux contraintes techniques et aux évolutions du projet.

•           Curiosité scientifique et volonté d’apprendre de nouvelles approches.

•           Bonnes compétences en communication et en documentation scientifique.



Rejoindre l'université de Montpellier, c'est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.

Nos avantages :
> Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes
> Jusqu’à 46 jours de congés / an (pour un temps plein à 38h30)
> Temps de travail aménageable
> Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM)
> Restauration collective
> Aide et prestations sociales
> Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville
> Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université
> Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade
Avantages dépendant de la nature et la durée du contrat, des nécessités de services et des conditions d'éligibilité 

Informations complémentaires :

Rémunération : 2160€ bruts mensuels, dont 200€ d'indemnité mensuelle des agents contractuels (prime)

Prise de poste : Avril

Type de contrat : CDD de catégorie A

Durée du contrat : 14 mois

Clôture des candidatures : 09/04/2026

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Pour rappel : les CV sans photographie sont à privilégier
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