Une université d’excellence
Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).
Une université engagée
Vigilante envers toutes formes de discriminations, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. Elle est attachée aux fondements du service public, à la laïcité, à l’égalité des chances et à l’accès de tous aux savoirs. Elle promeut les valeurs académiques telles que l’éthique, l’intégrité scientifique et la liberté universitaire. L’UM place enfin le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.
Dans le cadre de ses engagements, l’université promeut le CV sans photographie.
Structure de rattachement : Marine Biodiversity Exploitation and Conservation (MARBEC)
Intitulé du projet : BiodivMed 2024 : réseau de surveillance de la biodiversité marine méditerranéenne
Acronyme du projet : biodivmed
Durée globale du projet : 13 mois
Description sommaire du projet : Échantillonner l'ADNe sur 45 sites côtiers et 55 sites hauturiers en Méditerranée en intégrant à la fois des sites impactés et des sites protégés. Ces sites sont complémentaires de l'opération réalisée en 2023.
Mission principale : La personne recrutée participera au développement de nouveaux indicateurs écologiques à partir de l’ADN environnemental (diversité génétique, abondance). Elle réalisera les analyses bio-informatiques des projets concernés et sera amenée à conduire des expériences au laboratoire. Elle participera à la veille technologique et au fonctionnement du groupe.
Définition des tâches à accomplir :
Analyses de métabarcoding, SNP calling, assemblage de génomes et autres traitements de données de séquençage (MinION, NGS), design d’amorces ; veille bibliographique ;
Travaux de laboratoire (extraction, amplification, capture, tests d’amorces) ;
Participation à la base de référence ; programmation (Python, C, R, bash) et réalisation de workflows sur cluster de calcul ;
Aide au stockage et à l’analyse des données ;
Appui aux analyses de génétique des populations ;
Appui à l’organisation des réunions de projet, aux commandes et à la rédaction de rapports.
Description précise de l'évènement ou du résultat objectif déterminant la fin de la relation contractuelle ainsi que les modalités d'évaluation et de contrôle de ce résultat :
Réaliser le metabarcoding de l'ADNe sur ces échantillons pour les poissons et les crustacés en milieu côtier et en ajoutant les mammifères marins pour le milieu hauturier. Le livrable sera un fichier de données
Qualifications / Domaine de formation demandé :
Compétences en bio-informatique (analyse de données de séquençage haut débit, métabarcoding de l’ADN environnemental, filtrage de données SNP, extraction de données) ;
Maîtrise des outils d’analyse de séquençage haut débit ;
Programmation (Python, C, R, bash) ;
Bases solides en biologie moléculaire ;
Connaissances en statistiques et en génétique des populations
Rejoindre l'université de Montpellier, c'est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.
Nos avantages :
> Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes
> Jusqu’à 46 jours de congés / an (pour un temps plein à 38h30)
> Temps de travail aménageable
> Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM)
> Restauration collective
> Aide et prestations sociales
> Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville
> Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université
> Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade
Avantages dépendant de la nature et la durée du contrat, des nécessités de services et des conditions d'éligibilité
Informations complémentaires :
Rémunération : de 2160 € à 2325 € bruts mensuels, dont 200 € d'indemnité mensuelle des agents contractuels (prime)
Prise de poste : septembre 2026
Type de contrat : CDD de catégorie A
Durée du contrat : 13 mois
Clôture des candidatures : 31/07/2026