Ingénieur biologiste en analyse de données (F/H)

CDD
21 mois
Montpellier

A propos de nous

Une université d’excellence

Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).

Une université engagée

Vigilante envers toutes formes de discriminations, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. Elle est attachée aux fondements du service public, à la laïcité, à l’égalité des chances et à l’accès de tous aux savoirs. Elle promeut les valeurs académiques telles que l’éthique, l’intégrité scientifique et la liberté universitaire. L’UM place enfin le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.
Dans le cadre de ses engagements, l’université promeut le CV sans photographie.

Structure de rattachement : Laboratory of Pathogens and Host Immunity (LPHI)

Mission proposée

Intitulé du projet : Decoding the signaling and activation processes for exocytosis of rhoptry virulence factors in Toxoplasma gondii

Acronyme du projet : ToxoRISE

Durée globale du projet : 48 MOIS

Description sommaire du projet : La capacité des parasites Apicomplexes (Plasmodium, Toxoplasma) à infecter leurs hôtes dépend de la sécrétion coordonnée de deux organites sécrétoires spécialisés, appelés micronèmes et rhoptries. La façon dont leur contenu est déchargé est une question fondamentale en microbiologie moléculaire, car elle régit l'invasion des cellules hôtes et la dissémination de ces importants pathogènes eucaryotes. Nos travaux antérieurs ont révélé la composition structurelle et moléculaire de l'appareil sécrétoire des rhoptries, qui représente un nouveau système sécrétoire eucaryote ; mais la manière dont cette machinerie est activée reste énigmatique. Le projet vise à décrypter les mécanismes de signalisation et activation de la sécrétion des rhoptries, ainsi que de construire un modèle à haute résolution de cette machine de sécrétion.

Mission principale : L’ingénieur recruté sera en charge de la cartographie moléculaire et fonctionnelle de la machine de sécrétion.

Définition des tâches à accomplir : L’ingénieur recruté aura pour mission de purifier le complexe de la machine de sécrétion en vue de réaliser des expériences de cross-linking et d’analyse par spectrométrie de masse, mais aussi pour une analyste structurale par cryo-elctron-tomographie. Il participera également à la génération de mutants parasitaires et à l’étude de la fonction de certaines protéines de la machine de sécrétion.   

Description précise de l'événement ou du résultat objectif déterminant la fin de la relation contractuelle ainsi que les modalités d'évaluation et de contrôle de ce résultat : Plus précisément, l’ingénieur recruté aura pour mission de développer et d’optimiser des protocoles de purification de complexes protéiques à partir de parasites. Il partira de protocoles existants qu’il devra adapté en collaboration avec des partenaires de l’ANR. Cette activité impliquera une forte capacité d’initiative, notamment dans les interactions avec des spécialistes, ainsi que la mise en place et le suivi d’améliorations méthodologiques fondées sur une analyse critique de la littérature. Une veille technologique régulière sera également attendue.

La personne recrutée participera à la formation et à l’encadrement d’étudiants de Master 2 et de doctorat sur des approches de biologie moléculaire et cellulaire, incluant la conception de constructions CRISPR/Cas9, le clonage, la transfection de parasites et l’analyse phénotypique.

Au cours du projet, les complexes protéiques purifiés seront transmis aux partenaires de l’ANR pour des analyses structurales et protéomiques, notamment en cryo-tomographie électronique (groupe de Yi-Wei Chang, University of Pennsylvania, États-Unis) et en cross-linking couplé à la spectrométrie de masse (groupe de Julia Chamot-Rocke, Institut Pasteur). À l’issue du contrat, des échantillons de complexes protéiques purifiés, en quantité et qualité suffisantes, devront être fournis pour ces analyses. Les résultats obtenus donneront lieu à des publications scientifiques.

Contrainte du poste : La culture des parasites peut nécessiter des interventions en dehors des horaires habituels de travail afin d’assurer le renouvellement des milieux de culture et la collecte des parasites.  

Notre profil idéal

Qualifications / domaine de formation demandé :

Biochimie et biologie moléculaire. Conception et génération de mutants parasitaires par CRISPR/Cas9. Maîtrise de la culture cellulaire, de l’immunofluorescence et de la microscopie photonique. Veille bibliographique sur le sujet.



Rejoindre l'université de Montpellier, c'est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.

Nos avantages :
> Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes
> Jusqu’à 46 jours de congés / an (pour un temps plein à 38h30)
> Temps de travail aménageable
> Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM)
> Restauration collective
> Aide et prestations sociales
> Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville
> Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université
> Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade
Avantages dépendant de la nature et la durée du contrat, des nécessités de services et des conditions d'éligibilité 

Informations complémentaires :

Rémunération : de 2405€ à 2925€ bruts mensuels, dont 220€ d'indemnité mensuelle des agents contractuels (prime)

Prise de poste : Octobre

Type de contrat : CDD de catégorie A

Durée du contrat : 21 mois

Clôture des candidatures : 25/07/2026

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Pour rappel : les CV sans photographie sont à privilégier
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