Ingénieur biologiste en plateforme scientifique (F/H)

Intitulé du projet : Mettre au point un organe-sur-puce bronchique humain immunocompétent complexe afin d'étudier l'inflammation provoquée par des facteurs de stress environnementaux (infection, pollution) 

Acronyme du projet : IMMUNOLUNG

Durée globale du projet : 24 mois 

Description sommaire du projet : Développement d’un modèle organoïde complexe de poumon pour étudier l'inflammation provoquée par des facteurs de stress environnementaux (infection, pollution). Le but est de développer une nouvelle plateforme pour explorer comment l’exposome influence la physiopathologie respiratoire. Le projet capitalise sur l’expertise de différentes équipes sur les domaines du développent d’organoïdes, de l’immunologie, de la virologie et des approches de microfluidique.

Intitulé du poste à pourvoir  : lngénieur-e biologiste en plateforme scientifique

Mission principale : Développement d'organoides 3D de poumons immunocompétents et infectables par des virus respiratoires.

Définition des tâches à accomplir :

1/ Réaliser des études sur culture de cellules 2D/3D (à partir de lignées cellulaires, ou NHEB, ALI)

·         Mettre en œuvre des procédures de culture de purification de cellules immunitaires à partir des échantillons de sang en laboratoire L2 et L3 (neutrophiles, monocytes, macrophages, …)

·         Mettre en œuvre des procédures de culture de cellules épithelailes bronchiques et de cellules immunitaires en laboratoire L2 et L3

·         Faire de la culture cellulaire et infection en L3 (virus respiratoires: SARS-CoV-2 et variants, et RSV)

·         Mettre en œuvre les procédures pour une caractérisation multiparamétrique phénotypique et fonctionnelle de la réponse immunitaire (cytométrie multiparamétrique, RTqPCR, ELISA…)

·         Réaliser des infections de virus respiratoires dans les organoides

·         Réaliser des marquages (immunohistochimie et hybridation in situ)

·         Réaliser des tests   Elisa, Cytokines

·         Analyser les résultats obtenus

·         Rédiger un compte-rendu sur le cahier de laboratoire et le présenter en réunion

2/ Fabriquer des organoides 3D à partir d'IPS de poumons (iALI) en collaboration avec le laboratoire de J.DeVos si nécessaire

·         Culture d'iPSC : changement de milieux, passages, congélation

·         Contrôles qualités sur iPSC et iALI : Immunologie, RTqCR, imagerie

·         Rédiger un compte- rendu sur le cahier de laboratoire et le présenter en réunion

3/ Rédiger des protocoles expérimentaux de travail:

·         Mettre en place des protocoles expérimentaux

·         Rédiger les protocoles

·         Présenter les protocoles à l'équipe

4/ Participer à la vie quotidienne du laboratoire:

·         Gérer les stocks et les  commandes

·         Participer aux nettoyage (désinfections) des appareils et pièces d'expérimentations en L3

·         Participer aux astreintes L3 du week-end

·         Participer aux différentes réunions du laboratoire à l'IRMB (M. Pelegrin/J. De Vos) et à CEMIPAI (CNRS de Montpellier)

·         Interagir avec les autres plateformes locales (ou nationales)

Description précise de l'événement ou du résultat objectif déterminant la fin de la relation contractuelle ainsi que les modalités d'évaluation et de contrôle de ce résultat : Rapport de l'approche méthodologique pour la génération d'organoïdes de poumon 3D immunocompétents et mis à disposition du modèle à la communauté scientifique (publication).  

Contrainte du poste :      

•           Travail en confinement (L2, L3).

•           Contraintes horaires liés aux procédures expérimentales.

•           Travail multi-site (laboratoires dans différents sites, tous locales)

•           Une présence au laboratoire pourra être nécessaire pendant le week end pour la culture des iALi. Elle sera organisée par alternance.

•           Une partie du travail s'exercera au sein du CEMIPAI basée au CNRS de Montpellier

•           Les ports de la blouse, de chaussures fermées et de gants sont nécessaires. Une tenue spécifique est obligatoire au sein du laboratoire confiné de type 3.

•           Le poste nécessite de travailler avec des agents pathogènes de niveau 3 (Virus respiratoires). Une présence au laboratoire pourra être organisée par alternance le week-end.